El Centro Santa María Micaela de Santander define y especifica su misión en fidelidad al carisma y estilo pedagógico de Santa María Micaela:

1. Ante las familias: Responder a sus expectativas ayudándolas a implicarse corresponsablemente en el proceso educativo de sus hijos, estableciendo cauces de sintonía con la escuela.
2. Ante los alumnos: Ayudarles a formarse integralmente como honrados ciudadanos y buenos cristianos, con capacidad crítica, autonomía personal, sentido de la responsabilidad y coherencia en su vida diaria.
3. Ante los educadores: Construir entre todos un buen ambiente educativo, caracterizado por el interés compartido en la actividad educativo-pastoral, por la tarea de ser guías y acompañantes del proceso educativo y por el empeño de un trabajo en equipo.
4. Ante la sociedad: Ayudar a construir una sociedad de ciudadanos responsables y respetuosos con una propuesta educativa original que, conforme al carisma de Santa María Micaela, responda a las necesidades de los alumnos más desfavorecidos.

La visión de futuro del Centro Sta. María Micaela de Santander nos compromete a la búsqueda de un:

•   COLEGIO CON UNA IDENTIDAD PROPIA.
•   COLEGIO DE CALIDAD EN SU ORGANIZACIÓN Y EFICACIA.
•   COLEGIO INTEGRADO EN EL ENTORNO.
•   LUGAR DONDE LOS ALUMNOS ESTÁN PROTEGIDOS Y ACOMPAÑADOS.
•   LUGAR DONDE LOS PADRES PARTICIPAN Y SON ESCUCHADOS.
•   COLEGIO QUE PROMUEVE UN AMBIENTE FAMILIAR.
•   CENTRO QUE CULTIVA LA FORMACIÓN EN VALORES.
•   COLEGIO SOLIDARIO CON LOS MÁS DESFAVORECIDOS.

El Centro Sta. María Micaela de Santander favorece la experiencia y asimilación de los siguientes valores: Una "Pedagogía del amor" al estilo de Sta Mª Micaela que se manifiesta en la:

• ATENCIÓN AL NECESITADO COMO SUJETO PRIORITARIO
• CONSIDERACIÓN DEL "OTRO" COMO HERMANO
• CERCANÍA Y ESCUCHA
• AMBIENTE DE FAMILIA - ACOGIDA
• PREVENCIÓN
• SENTIDO DE RESPONSABILIDAD
• SENTIDO CRÍTICO
• AUTONOMÍA E INDEPENDENCIA SOCIAL E IDEOLÓGICA
• ASERTIVIDAD
• RESPETO DE LAS DIFERENCIASRESPONSABILIDAD: FIRMEZA - COHERENCIA